Ravissant joyau construit entre le XVIe et le XVIIIe siècle où se mêlent les styles renaissance pur et le baroque. Elle fut édifiée sur la mosquée almohade et l’ancienne cathédrale gotique, et c’est une oeuvre de Diego de Siloé, Gaspar Cayón et Vicente Acero. Elle est consacrée à la Encarnación del Virgen et son maître – autel est décoré avec d’intéressants tableaux de la Vierge. Elle compte avec un choeur baroque spectaculaire taillé par Ruiz del Peral, puis avec des majestueuses colonnes corinthiennes et ionique. Elle possède trois façades dédiées à la Anunciación, San Torcuato, patron de Guadix, et Santiago Apóstol. Elle se structure en trois nefs avec abside et déambulatoire.
Elle héberge le musée de la cathédrale, où on peut contempler des pièces et des objets artistiques très intéressants puis des livres divers du XVe au XVIIIe siècle. A côté de la cathédrale, se trouve, annexe, la paroisse ou Église Sagrario, dont la façade est construite en style plateresque.
