Il est situé à la Casa des Pisa. Cette maison fut construite après la reconquête de la ville et entra dans l’histoire pour l’accueil de la famille Pisa à Juan de Dios pour le guérir de sa maladie. En 1550 il mourut dans une des salles de la maison. Au XIXe siècle, l’Ordre Hospitalière de San Juan de Dios acquit le bâtiment.
Après avoir joué le rôle de Musée et de Centre de Documentation de l’Ordre, le bâtiment hébergea le patrimoine des plus de quatre cents ans d’histoire de l’ordre.