La primera sede de la ex-colegiata fue la antigua mezquita aljama musulmana, hasta que en 1529 se inició la construcción en estilo gótico. Un terremoto la derribó en 1531 y ese mismo año se encargó su reconstrucción, en estilo renacentista, a Alonso de Covarrubias y Rodrigo de Gibaia. Consta de tres naves cubiertas con bóvedas de crucería y girola. La torre, que sufrió daños años más tarde por otro terremoto, fue reconstruida nuevamente en el siglo XVIII.