Die Iglesia de San Miguel befindet sich im Convento de Santo Domingo und wurde von den Katholischen Königen in Auftrag gegeben. Sie besteht aus einem Schiff, fast rechteckig, mit dem Chor über der Eingangspforte. Das Besondere ist die mudejarische Deckentäfelung im zentralen Schiff und im Presbyterium. Es handelt sich dabei vielleicht um das abgeschlossenste und perfekteste der Kirchen von Guadix.